ようこそゲストさん
サイトマップ  |   ログイン パスワード   |   新規登録はこちら  
メインメニュー
サイト内検索

NIBB Open Campus

TechDiv 掲示板
TechDiv 掲示板は、日常の業務で困った点を相談したり、こんな工夫をしてみた等の情報を交換し合う場です。また業務以外にも交流の為の場も、設けてあります。是非ご活用下さい。登録ユーザなら誰でも参加できます。(ゲストの方は閲覧のみです)
[TechDiv 掲示板TOP]
[掲示板に戻る全部  1-  最新50
1 生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2007-10-31 14:20  [返信] [編集]

生物学に関係するツールを紹介するスレッドです。
ちょっと良いツールがあったら、是非ご紹介下さい。
2 4Peaks -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2007-10-31 14:26  [返信] [編集]

4Peaks
ABIのDNAシーケンサ3100系のデータをMacOS Xで表示できます。シーケンサのWindowsマシンから直接ファイルを持ってくるだけで、フォーマットの変換は必要ありません。プラグインで昨日の拡張もできます。
ダウンロードはこちら。
http://mekentosj.com/4peaks/
3 iPapers -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2007-11-6 9:52  SITE  [返信] [編集]

MacOS X用のPubMedに登録されている文献管理用データベースソフト。PDFファイルをDrag & Dropで登録できるお手軽さが売りです。
アップルのサイトに登録されてますが、
http://www.apple.com/jp/medical/software/018.html
このページからのリンクは切れてますので御注意。
上の[SITE]から行って下さい。


追記
Ver. 2.0で開発が止まっていますが、若干不安定との評判が…。
と、思ったら長い沈黙を破って 2.1α2が出ていますね。
http://sourceforge.net/projects/ipapers/files/

なお安定性は2より良いと言われている iPapers 1 は、ここからダウンロードできます。
http://homepage.mac.com/toshihiro_aoyama/iPapers/download.html
4 EnzymeX -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2007-12-6 11:28  SITE  [返信] [編集]

制限酵素消化する際の支援ソフトです。予め市販の制限酵素の情報が入力されてます。詳細、ダウンロードは、上の[SITE]から。
5 Biobar-生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2007-12-6 12:17  SITE  [返信] [編集]

FirefoxにEBI,NCBI,DDBJなどの検索ツールバーを追加します。
なかなか便利ですよ。
インストールは以下から、
http://biobar.mozdev.org/installation.html

biobar 1.5.3 for Firefox (1.0-2.0.*) and Flock
をクリックして下さい。

デフォルト等の変更は、ツール/アドオン/Biobarから設定ボタンをクリックすると設定パネルがでます。

ちなみにここのヤツ
https://addons.mozilla.org/ja/firefox/addon/169
をインストールすると、FireFox Version 2.0.0.11では、Firefoxが起動できなくなりました。上の2.0コンパチバージョンをご利用下さい。
6 Books for MacOS X -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2008-12-10 15:54  SITE  [返信] [編集]

生物学専用ツールというわけではないですが、便利なので紹介。
MacOS X用の書籍情報管理ツールです。ISBNの番号を打ち込むだけで、Amazon等から書籍情報を引っ張ってきてくれます。
さらにiSightのあるMacなら、カメラでバーコードを読みとって情報を取ってくることができます。
7 BibDesk -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2008-12-10 16:01  SITE  [返信] [編集]

MacOS X 用の文献管理ソフトです。PDFを自動で落としてきてくれないのがちょっと難点ですが、安定性はなかなかとの評判です。
8 CLCSequenceViewer -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2009-4-15 14:18  SITE  [返信] [編集]

とっくに紹介したと思っていたんですが…

CLC Bioによるフリーで使える配列解析ソフト。
同社のソフト群の機能お試し簡易版といった感じですが、

・制限酵素切断部位解析
• アラインメントの作成と編集
• 系統分類
• GenBank 検索
• DNA から タンパク質への翻訳

など、一通りの機能は持っているので、とりあえず突っ込んでおいて損はないかと。
Win、Mac、Linuxなどマルチプラットフォーム対応も魅力。
9 eBioX (+eBioTools) -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

takeshim 2009-4-15 14:27  SITE  [返信] [編集]

EMBOSSのツール群をMacOS X用にまとめたのがeBioTools、それにフロントエンドのためのGUIを提供するのがeBioXです。

…早い話が、EMBOSSのバイオインフォマティクスツールをMacで使いやすいようにしたもんです。
両方ぶち込んでやりましょう。

あ、X11 window systemが必要なので、あらかじめMacOS Xのディスクから突っ込んでおいてください。
MacOS X 10.4以降対応です。
10 Marvin Sketch -生物学関連ツール
takeshim
モデレータ

名無しさん 2011-1-21 16:06  SITE  [返信] [編集]

化学構造式のお絵かきソフトです。
コピペは…できないのかな。
これで書いたのを他のソフトに貼り付けるには、イメージでセーブしてって感じでしょうか。

JAVAが使える環境が必要です。
3次元分子モデル表示ツール MarvinSpace
構造式表示ツール Marvin View
も一緒にインストールされます。
[掲示板に戻る全部 次100 最新50
BluesBB ©Sting_Band
ゲストの方へ
 TechDivWebは、基礎生物学研究所技術課の紹介だけでなく、生物学をメインに広く技術に興味をお持ちの方を対象とした交流、情報交換を目的とするポータルサイトでもあります。
 ゲストでは書き込みできず、ご覧になれないコンテンツもあります。是非ユーザ登録し、我々のコミュニティにご参加ください。登録は上の「新規登録はこちら」をクリックしてください。
 登録の方法は、ユーザ登録マニュアルをご覧下さい。


本ホームページ内の文章・画像については、RSS以外の無断転載を禁じます。
当サイトへリンクをされる方は、なるべくお問い合わせからご連絡下さるようお願いします(クロスリンク等の対応を致します)。
Powered by XOOPS 2.0 (c) 2001-2006 The XOOPS Project
最近の投稿
トピックメニュー
Copyright (C) Technical Division of NIBB. All rights reserved.
Nishigonaka 38, Myodaiji, Okazaki 444-8585 Aichi, Japan